Prévu pour accueillir les trésors découverts ces dernières années dans la baie d'Alexandrie, ce musée dont l'ouverture au public est prévue pour 2012-2013, permettra au visiteur de plonger au coeur d'un monde antique. Il permettra ainsi de mettre en valeur les importantes découvertes archéologiques faites dans la baie d'Alexandrie au cours des deux dernières décennies. Situé à proximité de la Bibliothèque d'Alexandrie, le musée devrait comprendre deux parties : une "agora au-dessus des flots, véritable balcon ouvert sur la baie", émergée, reliée au continent, qui abritera la partie classique du musée destinée à accueillir les activités de stockage, de recherche et de traitement des vestiges. L'autre partie, sous-marine, sera signalée au moyen de quatre voiles émergeant de l'eau. Selon l'architecte, responsable du projet, Jacques Rougerie, "les points cardinaux et l'horloge du temps". Les visiteurs pourront, depuis la surface, emprunter un couloir sous-marin pour arriver dans une sorte d'anneau comportant des salles d'exposition thématiques. Salles dans lesquelles seront exposés des objets sortis de l'eau. Au centre de l'anneau, se trouvera un patio aquatique présentant des oeuvres qui ne peuvent être remontées à la surface. Un subterfuge faisant croire au visiteur que l'on admire les oeuvres à l'endroit même où elles reposent depuis des milliers d'années. Le bâtiment offrira au public la possibilité de suivre en direct le travail des archéologues, grâce à son patio aquatique, l'espace le plus original du musée. Toute l'architecture et la scénographie du musée seront conçues pour que chacun ressente, le temps d'une visite, le mystère des richesses millénaires englouties. En déambulant de découverte en découverte, le visiteur s'immergera dans une ambiance qui rappellera celle des sites archéologiques immergés.